O Conselho Gestor, órgão máximo da estrutura organizacional, é o responsável pela definição da política geral de administração da Fundação de Apoio para o Desenvolvimento da Educação Paraense (FADEP). Ele é composto por nove membros nomeados pelo Governador do Estado para um mandato de dois anos, podendo ser reconduzidos uma única vez.
TITULARES
Rossieli Soares da Silva
Arnaldo Dopazo Antonio José
Edilza Joana Oliveira Fontes
Carlos Edilson de Almeida Maneschy
Alessandra Silva da Silva
Renata Mirella Freitas Guimaraes de Souza Coelho
Elisângela Mara da Silva Costa
Luiziel Henderson Guedes
Rene de Oliveira e Sousa Junior